Esta Asociación se rige por una Asamblea General integrada por todos los socios y socias en sus diferentes modalidades y una Junta Directiva. La Asamblea es el órgano supremo de la Asociación y la Junta Directiva tiene la obligación de ejecutar los acuerdos que se hayan consensuado en la Asamblea. 

Para ello, ADENEX cuenta con grupos de trabajo, voluntarios/as y técnicos/as contratados/as.